Krystalografové se spojili v boji proti koronaviru

Jedno webové stránky IUCr upozorňuje na řadu klíčových objevů a poskytuje odkazy na volně dostupné zdroje pro výzkum koronaviru a COVID-19. Níže uvádíme některé pokroky profilované IUCr:

Na University of Texas (UT) ve Spojených státech, Jason McLellan použila nejmodernější technologii známou jako kryogenní elektronová mikroskopie (cryo-EM) k určení struktury spike proteinu koronaviru. Cryo-EM umožňuje výzkumníkům vytvářet 3D modely buněčných struktur, molekul a virů v atomovém měřítku. Poté, co čínští vědci zveřejnili sekvenci nového koronaviru, Dr. McLellan a jeho tým zkonstruovali variantu spike proteinu, aby zvýšili jeho stabilitu a expresi pro studium, a nařídili, aby byla nukleová kyselina syntetizována pro modifikovaný spike protein. V rámci 25 dní po obdržení upravené nukleové kyseliny naklonovali gen, exprimovali protein, izolovali jej, použili univerzitní zařízení cryo-EM k určení struktury a předložili svůj článek Věda, kde už to bylo zveřejněn.

Struktura spike proteinu 2019-nCoV v prefuzní konformaci

Toto je 3D mapa atomového měřítka nebo molekulární struktura spikeproteinu 2019-nCoV. Protein nabývá dvou různých tvarů, nazývaných konformace – jedna před infikováním hostitelské buňky a druhá během infekce. Tato struktura představuje protein předtím, než infikuje buňku, zvanou prefuzní konformace (obrázek s laskavým svolením The University of Texas at Austin).

Bezprostřední bývalý prezident IUCr Marvin Hackert použil souřadnice od Dr. McLellana k vytvoření 3D tištěného modelu, který Dr. McLellan ukázal na Fox National News v USA a na WXYZ-TV Detroit.

Mezitím poslední Společné polsko-německé krystalografické setkání v polské Wroclawi začala plenární přednáškou Rolfa Hilgenfelda (Univerzita v Lübecku, Německo) nazvanou „Od SARS k MERS a viru zápalu plic Wuhan 2020 – Jak může rentgenová krystalografie pomoci v boji proti nově se objevujícím virům“. Byly předloženy výsledky, které byly získány teprve ten den. Více se o těchto příbězích dozvíte v nadcházejícím vydání Newsletter IUCra na webu je k dispozici řada dalších zdrojů webové stránky IUCr, který je pravidelně aktualizován.

Virtuální číslo obsahující všechny články a abstrakty o koronavirech publikované v časopisech IUCr je k dispozici ve volně dostupném sborníku zde. 

Foto: Nový Coronavirus SARS-CoV-2 (NIAID přes Flickr)